Inverta o RSYNC. Então, troque pelo dir1 e pelo dir1.back e adicione o sinalizador de exclusão para garantir que ele remova os arquivos conforme apropriado para garantir que ele seja sincronizado corretamente e não apenas ignorar os arquivos que não estavam presentes no diretório1 originalmente.
rsync -avz --delete dir1.bak/ dir1/