Supondo que você queira esconder uma partição não montada do thunar, adicione uma linha no seu /etc/fstab , usando none como colunas de ponto de montagem e tipo fs;)
Existe uma maneira de ocultar uma partição ext4 de, por exemplo, Thunar ?
E a caixa de diálogo open file/save , acho que eles vêm da mesma fonte.