Se você usa drivers do fornecedor da placa gráfica, eles podem ter um bug no driver que faz com que a placa superaqueça ao assistir o vídeo.
Se você usar o driver proprietário para a placa gráfica, tente o código-fonte aberto e vice-versa.
Os fornecedores de cartões Grahics que suportam Windows ou Linux de uma forma melhor ou pior não são culpa de nenhum sistema operacional.