Este comentário ajudou-me a resolver isto
"Remover o último backup corrompido"
Todos os arquivos .part são backups incompletos
ll /srv/mysql/logs/duply_backup/duply_cache/duply_database/*.part
Remova os backups incompletos. Se você quiser ser mais conservador, a saída informa quais arquivos estão causando problemas.
Processing local manifest /srv/mysql/logs/duply_backup/duply_cache/duply_database/duplicity-full.20171010T231503Z.manifest.part
Além disso, você pode apenas limpar todos os *.parts
rm /srv/mysql/logs/duply_backup/duply_cache/duply_database/*.part
Funciona corretamente depois de remover esses arquivos. Esses são todos backups incompletos e devem ser limpos de qualquer maneira.