A ajuda do BusyBox aparentemente não exibe todos os comandos disponíveis. Ls, e presumivelmente outros comandos estavam no meu caso realmente disponíveis.
As configurações padrão dos consoles impediram que a entrada do teclado entrasse corretamente em alguns casos, resultando em um comportamento errático do shell, que fazia com que parecessem que os comandos não estavam presentes.
Depois de alterar as configurações padrão TTY de "console" para "tty1" e a taxa de transmissão para "38400" tudo, incluindo o ls comando funcionou bem.