Como você usou o parâmetro permanente, só é possível reverter manualmente excluindo a mesma entrada.
ip -6 neighbour delete fe80::1 lladdr 28:99:3a:4d:23:91 dev eth0 nud permanent
Não sei por que seu provedor de VPS está lhe dizendo para fazer isso se o IPv6 estivesse acessível antes.
Para voltar a um estado de configuração automática sem reiniciar o tipo
ip -6 neighbour flush
ip -6 neighbour
Isso faz com que você tenha IPv6 sem estado. Se ainda não estiver recebendo um IP, tente
dhclient -6
Se isso não funcionar, você precisa de mais informações do seu provedor de VPS.