Seu / boot e / boot / efi estão em partições separadas. O firmware UEFI espera refinar os arquivos ausentes na partição de sistema EFI, que é montada em / boot / efi, mas agora eles estão em / boot.
Mova os arquivos para / boot / efi, ou melhor ainda, mescle os dois sistemas de arquivos para que a partição do sistema EFI seja montada em / boot.