O que você deve fazer é instalar o Django em um virtualenv
e não diretamente na sua instalação do python (2.6 ou 3.5). Onde você instala virtualenv
não é importante (provavelmente vai para a instalação 2.6):
pip install virtualenv
agora crie um 3.5 virtualenv fazendo:
virtualenv -p $(which python3.5) /opt/django
(adapte o /opt/django
às suas necessidades) e, em seguida, instale dentro deste virtualenv baseado em 3.5:
/opt/django/bin/pip install django
ou primeiro ativar o virtualenv (no Bash) e depois instalar
source /opt/django/bin/activate
pip install django