As gemas geralmente não são instaladas por meio do portage. Para instalar uma jóia Ruby, verifique se rubygems está mesclado e, em seguida, execute gem20 install <gem> ou gem21 install <gem> dependendo do seu sistema.
Edit: como emerge --search mysql-minimal não retorna nada, você sabe que não está na árvore do portage e não pode ser instalado com o emerge. A execução de gem search mysql2 mostra que a biblioteca pode ser instalada com gem install mysql2 .