Você tem uma boa avaliação dos sistemas de arquivos conhecidos no Phoronix . Bem, é claro, o que você deve usar depende inteiramente de você, pois é difícil não dar uma resposta opinativa.
Quanto a seus medos sobre a Samsung, o F2FS é de código aberto e GPLv2. Portanto, em qualquer caso, ele permanecerá empilhável até certo ponto; veja o que acontece com o reiser4, por exemplo - independentemente de como as pessoas o vejam, o reiser4 ainda está sendo desenvolvido; lento, mas desenvolvido ainda e correções estão disponíveis - pode não ser o melhor exemplo Apesar ;-). Se algo der errado com o F2FS, provavelmente será bifurcado, dependendo da taxa de sucesso.
Tecnicamente falando, o F2FS está sendo desenvolvido com o eMMC em mente, o que o torna muito adequado para esse tipo de armazenamento. Ter a Samsung por trás disso também significa que eles estão sempre dando horas de trabalho para o desenvolvimento.