Eu realmente não entendi sua pergunta. Você deseja criar um atalho na área de trabalho ou um atalho na barra lateral. Se você quiser criar o atalho da área de trabalho, o seguinte tutorial é muito fácil de seguir
% bl0ck_qu0te%Basta instalar o gnome-desktop-item-edit e usá-lo. Depois de criar o arquivo .desktop, você também precisa baixar o ícone para o atalho. Apenas google isso.
Este é o meu código do arquivo .desktop
#!/usr/bin/env xdg-open
[Desktop Entry]
Version=1.0
Type=Application
Terminal=false
Icon[en_US]=/
Name[en_US]=MATLAB-R2012a
Exec=/usr/local/MATLAB/R2012a/bin/matlab -desktop
Comment[en_US]=Running MATLAB
Name=MATLAB-R2012a
Comment=Running MATLAB
Icon=/usr/local/MATLAB/R2012a/matlabicon.png
Atenciosamente,
Nam