Você pode usar VMware Converter para converter a partição para uma VM. Depois disso, você ainda precisará remover a partição Kali e estender sua partição do Windows.
Se o Windows não visualizar a partição do Windows, tente o QTParted em um LiveCD do Knoppix. Quando a partição for removida, você poderá estender sua partição do Windows. Já fiz isso várias vezes e não acho que estender uma partição do Windows tenha grandes riscos associados a ela. Se você quiser ter certeza, faça um backup primeiro.