Apenas o primeiro comando nesse pipeline ( ps ax ) está sendo executado como root. O restante da linha (incluindo o comando kill ) está sendo executado como seu usuário não root normal.
Para executar a raiz kill as, você precisa executá-la assim:
ps ax | grep node | awk '{print $1}' | sudo xargs kill -9
ou
ps ax | grep node | awk '{print $1}' | xargs sudo kill -9
alternativamente, se você tiver pkill instalado, poderá executar:
sudo pkill -9 node