Eu recomendaria, especialmente desde que você não é um usuário avançado, um backup separado / home, como acima, e periódico para mídia ótica: barato, fácil e confiável. Se você realmente tem dados importantes, eu pensaria em outra coisa.
Eu quero instalar o Ubuntu 12 e gostaria de particionar meu disco rígido para que o sistema operacional viva em sua própria partição e os dados em um diferente. Assim, se o sistema quebrar por algum motivo, os dados permanecerão intactos. Existe uma maneira melhor de fazer isso?
Você pode querer considerar o seguinte, porque a partir de um único disco rígido, se isso tiver um problema de hardware, não importa como sua tabela de partição se parece.
Além disso, há alguns guias Melhores práticas de particionamento como o que eu vinculei a você pode querer dar uma olhada.