Isso porque a ferramenta GUI (eu acho que é baobab ) não leva em consideração as diferentes partições, apenas olha para a árvore de diretórios. Isso significa que ele vê /home como um subdiretório de / , mas não considera que é uma partição separada.
Se você observar sua df output:
/dev/sda5 38G 23G 14G 64% /<br>
/dev/sda7 146G 48G 91G 35% /home
você tem 23G usados em / e 48G usados em /home . 48 + 23 = 71, então baobab está relatando 71G usado em / .