Primeiro, para evitar bagunçar, você deve fazer backup de uma imagem inteira do disco (desde que você tenha um disco maior para armazená-lo). Para isso, várias soluções são propostas nesta questão , da última vez que fiz isso, usei dd . Quando tiver certeza de que você pode restaurar a imagem em caso de problema, você pode usar testdisk para redetectar a tabela de partição e corrigi-la.
Esta questão , por exemplo, fornece uma solução.