Eu tive esse problema e esse link funcionou para mim.
Correção do driver ATI Catalyst
Se você quiser telas duplas e ATI em 12, use o driver proprietário do catalisador e NÃO o Ubuntu, pois isso causa uma tonelada de problemas aleatórios ...
P.S. esta é a ÚNICA vez que eu já avisei sobre propriedade e me sinto suja por ter que ...