Em vez de mesclar as partições do sistema EFI, deixe-as separadas se você tiver sistemas operacionais em ambos os discos. Isso também mantém ambos os discos inicializáveis independentemente.
O que você deseja é que o GRUB detecte sistemas operacionais em outros discos. Para isso, instale o pacote os-prober
e execute grub-mkconfig
.
Você também pode deixar as entradas existentes do menu UEFI no lugar para que você possa inicializá-las separadamente, se você escolher.