Você pode criar um script de shell e colocá-lo em ~/.config/autostart
(crie o diretório manualmente se ele não existir) para que ele seja executado depois que o GDM for iniciado.
#!/bin/bash
xrandr --setprovideroutputsource modesetting NVIDIA-0
xrandr --output HDMI-0 --mode 1920x1080 --primary --pos 0x0 --output VGA-1-1 --mode 1920x1080 --pos 1920x0
Certifique-se de tornar o script do shell executável com chmod u+x
.