Se você criou um link simbólico como este:
ln -s "$HOME/Dropbox (Company)" "$HOME/Dropbox"
... então você deve estar todo configurado e os aliases não precisarão ser alterados (já que acessar $HOME/Dropbox levará você para $HOME/Dropbox (Company) através do link simbólico).
Isso pressupõe que você removeu o diretório $HOME/Dropbox original ou teria problemas ao criar o link corretamente.