Gostaria de ter certeza de que você está permitindo o ICMP para descoberta de caminho MTU dentro do VPC.
Ao passar pela internet pública, você limitará a 1500 bytes, mas no VPC você terá quadros Jumbo. Se houver uma diferença no tamanho da unidade de transmissão máxima (MTU) no caminho de rede entre os dois hosts sem a descoberta de PMTU devido ao ICMP bloqueado, você verá esses tipos de pausa.
Esse é um problema bastante comum até mesmo nos principais serviços da AWS, se os grupos de segurança bloquearem o ICMP. Aqui está um link para uma página que pode estar relacionada ao redshift, mas provavelmente é o mesmo problema.