Eu encontrei o changelog aqui . Estou pensando que 2.72
adicionou a funcionalidade que estou usando para carregar dnsmasq.d/*
.
Version 2.72
...
Extend --conf-dir to allow filtering of files. So
--conf-dir=/etc/dnsmasq.d,\*.conf
will load all the files in /etc/dnsmasq.d which end in .conf