Da saída que você postou, parece que o processo php
com PID
14234 está sendo executado como raiz e, na verdade, tem o arquivo kMiles
aberto
várias vezes, como indicam os diferentes FDs.
Se isto tiver elementos inesperados (o nome do arquivo, PHP rodando como root),
isso pode indicar um servidor comprometido, mas a saída de lsof
em si faz sentido.