Não é necessário limpar completamente um Disco Rígido antes de instalar o Linux sobre ele. Como alude nos comentários acima, basta dizer ao Instalador para usar todo o disco e ele substituirá totalmente o Windows pelo Linux.
Se, no entanto, você estiver preocupado com a segurança e com os arquivos do Windows que estão sendo recuperados ou você pode usar comandos do Linux, como aqueles mostrados no link ou use um programa separado como o DBAN - link
Para apagar totalmente um disco rígido, você precisa executar essas alternativas várias vezes. --- Embora algumas pessoas digam que o único método realmente seguro de lidar com um HDD é destruí-lo fisicamente. Sledge martelo alguém?