A questão interessante é como F1 em vez de Shift_L foi parar lá em primeiro lugar. Você pode modificá-lo para que ele funcione novamente, mas essa configuração incorreta, onde quer que esteja em seu sistema, deve ser corrigida.
Coloque as duas linhas seguintes
remove shift = F1
add shift = Shift_L
em um arquivo, por exemplo ~/.Xmodmap , execute o arquivo por meio de xmodmap ~/.Xmodmap . Verifique com xmodmap -pm se a tabela modificadora está correta agora.
Como alternativa, você pode usar -e para executar essas expressões a partir da linha de comando ( man xmodmap para detalhes).