É difícil dizer sem ver a saída real do SMART, mas muitos discos têm setores quebrados, que são sinalizados assim que são descobertos. Eles são descobertos ao acessá-los, portanto, escrever zeros em seu disco rígido pode aumentar a contagem de setores defeituosos (mas os setores já foram ruins antes).
É quase impossível criar setores ruins interrompendo um comando (com ctrl-c ou outro). Também não é possível não "consertar" setores defeituosos usando fsck.
Você pode forçar o remapeamento de setores defeituosos escrevendo para eles (por exemplo, dd com endereço de setor correto ), o que você já fez usando shred . Mas, se você quiser destruir o disco mesmo assim, não há necessidade de consertar nada.
Se você é realmente paranoico com os dados do seu disco, retire-o fisicamente (abra-o, use um machado, um strong magenet ou qualquer outro).