De iptables -m owner --help
:
owner match options:
[!] --uid-owner userid[-userid] Match local UID
Você precisa especificar um UID, não um nome de usuário. Então, tente:
-A OUTPUT -i eth0 -p tcp --dport 2049 -m owner --uid-owner 0 -m state --state NEW,ESTABLISHED -j ACCEPT