4.3 está desatualizado, você precisa atualizar sua distribuição do Kali Linux para o mais recente (4.4) e instalar os cabeçalhos:
apt-get update
apt-get dist-upgrade
reboot
Então você poderá obter os cabeçalhos:
apt-get install -y linux-headers-$(uname -r)
Como alternativa, você pode tentar obter os arquivos de cabeçalho de outro repositório. Adicione o seguinte repositório a /etc/apt/sources.list
:
deb http://httpredir.debian.org/debian/ jessie main contrib non-free