A maneira usual de fazer isso sem alterar muito é copiar o arquivo para o controle remoto e, em seguida, executá-lo, portanto, mantendo stdin disponível para sua entrada tty. Por exemplo
scp -P 2202 ~/scripts/$2 root@server$1:./myscript
ssh -t root@server$1 -p2202 bash ./myscript $3
ou se você não pode scp
substituir essa linha por
ssh root@server$1 -p2202 'cat >./myscript' <~/scripts/$2