Você realmente precisa usar a compactação NTFS?
Talvez seja melhor comprimir com o .tar.tgz usando a opção --rsyncable. Ele só enviará as diferenças de .tar.gz e economizará a largura de banda da rede.
Se você realmente precisa de mais nível de compactação, você pode usar o gzip -9. E se você realmente precisa economizar mais espaço, você pode usar o rdiff-backupt para salvar apenas as diferenças (você tem que preservar o arquivo original para recuperar). Eu não recomendo o rdiff-backup porque se você perder o arquivo original, você terá problemas.