Duhhhhhhhhhhhhhhh. Todo arquivo de log do MySql é um trabalho de logrotate. Ele estava girando semanalmente e fazendo cópias dele. O registro mais recente foi registrado em error.log , o que significa que error.log.1.gz era algo mais antigo.
Sim, eu me sinto idiota como o inferno. Vou deixar isso aqui se alguém se meter no mesmo problema que eu.