Duas situações vêm à mente:
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Atualização da biblioteca enquanto um processo usando esta biblioteca está sendo executado. O processo verá a versão antiga dessa biblioteca até ser reiniciada.
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Montando um dispositivo em um ponto de montagem já usado. Os processos em execução nesse ponto de montagem mantêm sua visão antiga.
Ambas as situações são corrigidas com uma reinicialização, mas não tenho certeza se isso se aplica à sua situação.