Parece que o que você precisa pode ser scp .
É cp over ssh , basicamente.
Você deseja copiar um diretório local para um diretório remoto,
você pode usar algo como
scp -r /home/user/localdir remoteuser@remotehost:/tmp/
Depois disso, você tem um diretório no remotehost com o nome localdir .
Veja man scp - ele usa apenas as mesmas conexões ssh .