O site security.kali.org pode ter tido um hickup. Tente fazer o ping:
[root@fly2 ~]# ping -c 3 security.kali.org
PING security.kali.org (173.246.39.190) 56(84) bytes of data.
64 bytes from http.kali.org (173.246.39.190): icmp_seq=1 ttl=57 time=126 ms
64 bytes from http.kali.org (173.246.39.190): icmp_seq=2 ttl=57 time=127 ms
64 bytes from http.kali.org (173.246.39.190): icmp_seq=3 ttl=57 time=126 ms
Isso indica que o site funciona. Você também pode tentar navegar para o link para ver se você recebe uma listagem de diretórios. Se isso funcionar, tente novamente.