Eu encontrei este site que dá a resposta à sua pergunta.
Um trecho:
Bootstrap Loader - Locate the operating system. If a capable operating system is located, the BIOS will pass control to it.
A partir disso, podemos dizer que não há nenhum papel da Bios em dizer que o sistema é compatível com o Linux ou não, desde que o sistema operacional esteja instalado corretamente.
Espero que isso ajude.