O Xorg é responsável pelo teclado, então você pode definir o layout do teclado em um arquivo xorg conf como /etc/X11/xorg.conf.d/10-keyboard.conf.
Existe em um exemplo de configuração de teclado
Section "InputClass"
Identifier "system-keyboard"
MatchIsKeyboard "on"
Option "XkbLayout" "us,cz"
Option "XkbModel" "pc104"
Option "XkbVariant" ",dvorak"
Option "XkbOptions" "grp:alt_shift_toggle"
EndSection
No XkbLayout você pode definir seu layout.
E a configuração do atalho de teclado depende do Desktop Manager que você está usando, normalmente há um lugar para definir isso na seção de configuração.