Em um arquivo de entrada como:
foo baaar
Eu conto 4 ocorrências de um caractere sendo repetido: oo , <NL><NL> , aa e aa .
Para contar os caracteres repetidos em uma linha, você pode usar a expressão regular perl -style como (.)(?=) . Para repetir a nova linha, você pode contar as linhas vazias, exceto se for a primeira linha.
Você pode se aproximar do GNU grep
grep -Po '^$|(.)(?=)' | wc -l
Mas isso contaria a primeira linha vazia, então você poderia removê-la primeiro ou adicionar um xx nas linhas vazias, exceto a primeira:
sed '1!s/^$/xx/' | grep -Po '(.)(?=)' | wc -l