A melhor maneira de corrigir esses setores defeituosos e se livrar dos avisos é fazendo backup, substituindo o hardware e restaurando (se a unidade for parte de um RAID-5, você deve apenas trocar a unidade e deixar o RAID software reconstruir o conteúdo).
Embora você possa se livrar dos problemas com esses setores ao remapear (ou fazer com que a unidade os remapeie para você, se for inteligente o suficiente), isso não elimina a causa dos problemas. Para mim, essas contagens de erros são altas para confiar no sistema para continuar trabalhando.