O Skype usa o Qt, não o Gtk +. Você pode verificar as bibliotecas com o comando ldd
:
> ldd /usr/lib32/skype/skype | grep Qt
libQtDBus.so.4 => /usr/lib32/libQtDBus.so.4 (0xf57aa000)
libQtWebKit.so.4 => /usr/lib32/libQtWebKit.so.4 (0xf40fa000)
libQtXml.so.4 => /usr/lib32/libQtXml.so.4 (0xf40b6000)
libQtGui.so.4 => /usr/lib32/libQtGui.so.4 (0xf35e1000)
libQtNetwork.so.4 => /usr/lib32/libQtNetwork.so.4 (0xf349c000)
libQtCore.so.4 => /usr/lib32/libQtCore.so.4 (0xf31ac000)
Meu palpite é que ele pode ter usado o Gtk + no passado, daí a página wiki, mas isso mudou para o Qt em algum momento do ano passado.