Minha sugestão foi fazer um backup de todo o root fs (incluindo / usr / local), então particioná-lo novamente, montar toda a partição e extrair tudo.
Depois disso, todos os seus arquivos permanecerão, e seu disco foi re-particionado.
Se você simplesmente faz o backup de / usr / local, corre o risco de que, assim que as bibliotecas do sistema forem atualizadas, esses softwares (não-estáticos) precisem ser re-vinculados.