A solução óbvia é criar o glibc 2.9, copiá-lo também (não sobrescrever o já existente!), depois executar o javafx com LD_LIBRARY_PATH="/old/glibc/libraries:$LD_LIBRARY_PATH"
prefixado. Como alternativa, coloque esse caminho no final de /etc/ld.so.conf e execute novamente o ldconfig
.