Isso desativará o serviço Bluetooth na inicialização:
# bluez - bluetooth daemon
description "bluetooth daemon"
#start on started dbus
stop on runlevel [0123456]
Parece que ocorreu um erro quando você editou o arquivo bluetooth.conf . Você comenta stop on stopping dbus ?
Se você quiser desativar o dispositivo bluetooth, tente removê-lo do carregamento do módulo do kernel na inicialização. Edite /etc/modprobe.d/blacklist.conf , adicione uma linha:
blacklist bluetooth