Mesmo que o problema seja resolvido, apenas para beneficiar aqueles que eventualmente chegarão aqui: além do já mencionado tree --du , vale mencionar que du tem uma opção --threshold que faz com que ele ignore diretórios ( ou arquivos) maior que o valor especificado (ou menor, se o limite for prefixado com um sinal de menos).
Para listar recursivamente apenas itens maiores que 1 GiB no diretório atual, você pode emitir o comando:
$ du -ahx --threshold=1GiB .
-a informa du para listar arquivos também.
-h lista tamanhos em formato legível por humanos.
Com a opção -x , diretórios (e arquivos) em sistemas de arquivos diferentes são ignorados. Útil ao inspecionar volumes que contêm pontos de montagem.