Você pode usar algo assim para obter o ID:
output=$(xinput --list |
sed -n '/AlpsPS.2 ALPS DualPoint TouchPad/s/.*id=\([0-9]*\).*//p')
mas na verdade você não precisa, pois você pode especificar o dispositivo para desativar pelo nome:
xinput --disable 'AlpsPS/2 ALPS DualPoint TouchPad'