Você está confundindo o volume físico e o volume lógico.
Você cria um grupo de volumes, feito de volumes físicos (discos / partições), que podem ser transformados em um ou mais volumes lógicos ("discos" montáveis).
Você está fora de extensão. Isso está dizendo que o seu PV está totalmente alocado. Que baseado no que você disse, está correto. Quando você executa o df, você pode ver o nível de consumo do LV, que gasta algum uso e algum espaço de soare.
As coisas estão funcionando como deveriam.