Ambos os plugins ( netrw e zip ) usam autocmds em prefixos de arquivos personalizados para detectar sistemas de arquivos especiais (remoto e zip, respectivamente) e, em seguida, delegam a leitura e gravação para o código do plugin personalizado. Eu acho que a combinação não funciona porque ambos usam o mesmo ponto de integração, mas eu acho que as integrações poderiam ser estendidas para que algum tipo de sintaxe funcionasse (mas poderia ser confuso).
Felizmente, ambos os plugins são mantidos pelo mesmo autor (DrChip), então sugira este aprimoramento ao autor (seu endereço de e-mail pode ser encontrado nos arquivos e na documentação do plug-in, por exemplo, em :help pi_netrw
).