Eu suspeito que esse bug do archlinux pode ser o mesmo problema: link
Se for esse o caso, então ele é corrigido pela versão 3.7.4 do kernel. Eu ainda não tentei - atualmente estou procurando uma solução, mas isso parece promissor, uma vez que descobri como instalar o kernel posterior.
Eu também tive problemas com um teclado USB, mas menos ainda.
Acho que, embora o mouse USB geralmente não funcione quando saio da hibernação, geralmente ele está funcionando se eu tentar mais tarde (normalmente é deixado ligado).