De qualquer forma, não estou ciente de fazer diretamente o que você está perguntando e, é claro, você encontrará problemas se file1 existir em folder1 e folder2 .
Você poderia criar links de cada arquivo / diretório em folder2 to folder1 , isso exigiria um link por arquivo / diretório em folder2 . Você poderia criar um script para manter os links atualizados e remover links inativos.
Se você usasse links físicos, tudo isso seria perfeito ao fazer uma listagem de diretórios, etc.
Você pode usar inotify para assistir folder1 e folder2 para acionar a criação / exclusão dos links físicos.