Você pode usar o Brasero para copiar um CD para um .iso; isso é instalado por padrão.
Selecione a opção para copiar um CD, selecione a unidade de CD como fonte e um arquivo de imagem como o destino ...
Ou de dentro do Nautilus: vá para "Computador", clique com o botão direito do mouse na unidade de CD e selecione "Copiar Disco ...". (Ou algo assim, estou usando um sistema de idioma local aqui.)