Então você quer executar as funções somente quando a variável correspondente está definida como TRUE? Eu faria algo como
[[ "$data_error_check_run" == TRUE ]] && data_error_check
[[ "$check_ctl_dat_exists_run" == TRUE ]] && check_ctl_dat_exists
[[ "$mask_field_run" == TRUE ]] && mask_field "$MASK_FILE"
[[
não altera as variáveis não definidas, portanto, não definir uma específica é o mesmo que defini-la como FALSE
.